Математическая модель распространения эпидемий: различия между версиями

Материал из sawiki
Перейти к навигации Перейти к поиску
Строка 37: Строка 37:
 
</math>
 
</math>
  
Здесь <math>p</math> — вероятность заражения, а <math>c</math> — среднее число контактов в единицу времени. Промежуток времени <math>t \in [T_1,\ T_2]</math> — окно, в течение которого индивидуум заразен.
+
Здесь <math>p</math> — вероятность заражения, а <math>c</math> — среднее число контактов в единицу времени. Промежуток времени <math>t \in [T_1,\ T_2]</math> — окно, в течение которого индивид заразен.
 
<br>
 
<br>
 
<br>
 
<br>
 
Таким образом, в частном случае <math>A(\tau)</math> можно ввести так::
 
Таким образом, в частном случае <math>A(\tau)</math> можно ввести так::
 
<math> A(\tau) = \underbrace{\beta N}_{c} \cdot \underbrace{\exp\{ -\gamma\tau \} }_{p},\ \ \beta=const,</math>
 
<math> A(\tau) = \underbrace{\beta N}_{c} \cdot \underbrace{\exp\{ -\gamma\tau \} }_{p},\ \ \beta=const,</math>
то есть, заражение распределено экспоненциально со средним <math>\frac{1}{\gamma}</math>. Следовательно, средняя длина промежутка времени, в течение которого индивид заразен, равна <math>\frac{1}{\gamma}</math>.
+
то есть промежуток времени для заражения других особей распределен экспоненциально со средним <math>\frac{1}{\gamma}</math>. Следовательно, средняя длина промежутка времени, в течение которого индивид заразен, равна <math>\frac{1}{\gamma}</math>.
 
<br>
 
<br>
 
<br>
 
<br>
'''''Замечание.''''' Введя подобным образом функцию инфективности, получают, что число контактов растёт линейно с общим объёмом популяции <math>N</math>, что, вообще говоря, является довольно грубым допущением. Однако оно необходимо для упрощения и наглядности исследования.
+
'''''Замечание.''''' Введя подобным образом функцию инфективности, получают, что число контактов растёт линейно с общим объёмом популяции <math>N</math>, что, вообще говоря, является довольно грубым допущением. Однако оно необходимо для упрощения исследования и его наглядности.
  
 
===Получение аналитического вида SIR-модели===
 
===Получение аналитического вида SIR-модели===
Строка 53: Строка 53:
 
<math>i(t) = \frac{S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) i(t-\tau) d\tau.</math>
 
<math>i(t) = \frac{S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) i(t-\tau) d\tau.</math>
  
В силу выведенной связи на <math>i(t)</math> и <math>S(t)</math>
+
Интеграл в правой части можно трактовать как среднее число "удачных" контактов (т.е. таких, при которых заражение произошло). Причём, в силу выведенной связи на <math>i(t)</math> и <math>S(t)</math> можно получить следующее::
 +
<math>
 +
\begin{equation} 
 +
\dot{S}(t) = \frac{S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau. \label{sys2}
 +
\end{equation} 
 +
</math>
 +
<br>
 +
<br>
 +
Далее вводится <math>I(t)</math> следующим образом::
 +
<math> I(t) = -\frac{1}{\beta} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau\ =\ \{s:=t-\tau\}\ =\
 +
-\frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-s) \dot{S}(s) ds\ =\ \{ \tau:=s\}\ =\ -\frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-\tau) \dot{S}(\tau) d\tau.</math>
 +
С учётом того, что функция инфективности <math> A(\tau) </math> введена так, что <math> \dot{A}(\tau) = -\gamma A(\tau)</math>, продифференцируем полученное равенство по параметру <math>t</math>::
 +
<math>
 +
\dot{I}(t) = -\frac{1}{\beta} A(0) \dot{S}(t) + \frac{1}{\beta} \underbrace{A(\infty)}_{= 0}\dot{S}(-\infty) - \frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t \left( -\gamma A(t-\tau) \dot{S}(\tau) \right) d\tau =
 +
</math>
 +
:
 +
<math>
 +
= -\frac{\beta N}{\beta}\dot{S}(t) + \gamma\cdot \underbrace{ \frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-\tau) \dot{S}(\tau) d\tau}_{= - I(t)} = \{ \text{в силу } (\ref{sys2}) \} = \underbrace{-\frac{N S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau}_{\beta SI} - \gamma I(t) = \beta S(t)I(t) - \gamma I(t).
 +
</math>
 +
 
 +
Таким образом, для <math>I(t)</math> получается следующее уравнение динамики — <math> \dot{I}(t) = \beta S(t) I(t) - \gamma I(t) = I(t) \left( \beta S(t) - \gamma \right)</math>.
 +
<br>
 +
<br>
 +
Итоговая динамическая система, описывающая SIR-модель, выглядит следующим образом::
 +
<math>
 +
\begin{equation}
 +
    \begin{cases}
 +
    \dot{S}(t) = - \beta S(t) I(t),\\
 +
    \dot{I}(t) = I(t)\left( \beta S(t) - \gamma \right),\\
 +
    \dot{S}(t) + \dot{I}(t) + \dot{R}(t) = 0.
 +
    \end{cases} \label{sys3}
 +
\end{equation}
 +
</math>
 +
Причём из системы <math>(\ref{sys3})</math> можно выразить и динамику класса переболевших — <math> \dot{R}(t) = \gamma I(t)</math>.
 +
 
 +
===Анализ SIR-модели===
 +
При исследовании полученной системы <math>(\ref{sys3})</math>, описывающей динамику SIR-модели,

Версия 21:03, 22 января 2025

Математические модели эпидемиологиидинамические системы, описывающие распространение инфекционных популяций среди здоровых.

Не все заболевания рассматриваются в рамках такого исследования: моделируются инфекции, вызываемые микропаразитами. В таком случае можно пренебречь динамикой каждого паразита (в отличие от случая макропаразитов), поскольку заболевание протекает у инфицированных с одинаковым характером. Поэтому обладания информацией о динамике здоровой популяции и заражённой достаточно для анализа модели.

Общая формулировка SIR-модели

Одна из простейших моделей распространения эпидемий — SIR-модель. Это модель ящикового вида, в которой все особи популяции разделяются на группы — "ящики", — внутри которых особи неразличимы.

Диаграмма эволюции особи популяции в SIR-модели

В SIR-модели все особи поделены на 3 группы:

  1. \(S(t)\) — подверженные заболеванию особи (от англ. susceptible)
  2. \(I(t)\) — заражённые особи (от англ. infected)
  3. \(R(t)\) — переболевшие (от англ. resistant)


Важно отметить, что ящиковая модель, в том числе и SIR-модель, подразумевает собой замкнутую популяцию, в которой не происходят процессы рождаемости и смертности. Поэтому на введённые классы можно выписать ограничение\[ S + I + R = N, \] где \( N \) — общее число особей популяции.

Замечание. Из замкнутости популяции и характера эволюции особи можно сделать вывод, что с течением времени "ящик" \(I\) заражённых особей станет пустым.

Исследование SIR-модели

Функция инфективности

Для анализа сформулированной модели вводится функция инфективности \(A(\tau)\), которая характеризует вероятность того, что произойдёт заражение индивида при контакте с заражённым индивидом \(\tau\) единиц времени назад.

В общем виде функция инфективности выглядит следующим образом:\[ A(\tau) = \begin{equation} \begin{cases} c \cdot p,\ \ t \in [T_1,\ T_2]\\ 0,\ \ \text{иначе}. \end{cases} \label{sys1} \end{equation} \]

Здесь \(p\) — вероятность заражения, а \(c\) — среднее число контактов в единицу времени. Промежуток времени \(t \in [T_1,\ T_2]\) — окно, в течение которого индивид заразен.

Таким образом, в частном случае \(A(\tau)\) можно ввести так:\[ A(\tau) = \underbrace{\beta N}_{c} \cdot \underbrace{\exp\{ -\gamma\tau \} }_{p},\ \ \beta=const,\] то есть промежуток времени для заражения других особей распределен экспоненциально со средним \(\frac{1}{\gamma}\). Следовательно, средняя длина промежутка времени, в течение которого индивид заразен, равна \(\frac{1}{\gamma}\).

Замечание. Введя подобным образом функцию инфективности, получают, что число контактов растёт линейно с общим объёмом популяции \(N\), что, вообще говоря, является довольно грубым допущением. Однако оно необходимо для упрощения исследования и его наглядности.

Получение аналитического вида SIR-модели

Рассмотрим ещё одну величину \(i(t)\) — число новых заболевших в момент времени \(t\). Таким образом, \(i(t) = -\dot{S}(t)\).

При этом \(i(t)\) можно выразить через уже введённую функцию инфективности:\[i(t) = \frac{S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) i(t-\tau) d\tau.\]

Интеграл в правой части можно трактовать как среднее число "удачных" контактов (т.е. таких, при которых заражение произошло). Причём, в силу выведенной связи на \(i(t)\) и \(S(t)\) можно получить следующее:\[ \begin{equation} \dot{S}(t) = \frac{S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau. \label{sys2} \end{equation} \]

Далее вводится \(I(t)\) следующим образом:\[ I(t) = -\frac{1}{\beta} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau\ =\ \{s:=t-\tau\}\ =\ -\frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-s) \dot{S}(s) ds\ =\ \{ \tau:=s\}\ =\ -\frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-\tau) \dot{S}(\tau) d\tau.\] С учётом того, что функция инфективности \( A(\tau) \) введена так, что \( \dot{A}(\tau) = -\gamma A(\tau)\), продифференцируем полученное равенство по параметру \(t\):\[ \dot{I}(t) = -\frac{1}{\beta} A(0) \dot{S}(t) + \frac{1}{\beta} \underbrace{A(\infty)}_{= 0}\dot{S}(-\infty) - \frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t \left( -\gamma A(t-\tau) \dot{S}(\tau) \right) d\tau = \] \[ = -\frac{\beta N}{\beta}\dot{S}(t) + \gamma\cdot \underbrace{ \frac{1}{\beta} \int\limits_{-\infty}^t A(t-\tau) \dot{S}(\tau) d\tau}_{= - I(t)} = \{ \text{в силу } (\ref{sys2}) \} = \underbrace{-\frac{N S(t)}{N} \int\limits_0^{\infty} A(\tau) \dot{S}(t-\tau) d\tau}_{\beta SI} - \gamma I(t) = \beta S(t)I(t) - \gamma I(t). \]

Таким образом, для \(I(t)\) получается следующее уравнение динамики — \( \dot{I}(t) = \beta S(t) I(t) - \gamma I(t) = I(t) \left( \beta S(t) - \gamma \right)\).

Итоговая динамическая система, описывающая SIR-модель, выглядит следующим образом:\[ \begin{equation} \begin{cases} \dot{S}(t) = - \beta S(t) I(t),\\ \dot{I}(t) = I(t)\left( \beta S(t) - \gamma \right),\\ \dot{S}(t) + \dot{I}(t) + \dot{R}(t) = 0. \end{cases} \label{sys3} \end{equation} \] Причём из системы \((\ref{sys3})\) можно выразить и динамику класса переболевших — \( \dot{R}(t) = \gamma I(t)\).

Анализ SIR-модели

При исследовании полученной системы \((\ref{sys3})\), описывающей динамику SIR-модели,